Estudió órgano en el Conservatorio Estatal de Bratislava, en el Conservatorio Diocesano de Viena y en la Academia de Música y Arte Dramático de Bratislava con Ivan Sokol y de forma privada con Johann Trummer en Graz. Participó en numerosos servicios litúrgicos retransmitidos (la toma de posesión de los presidentes eslovacos desde 1989, la visita del Papa Juan Pablo II, etc.). Como solista, actuó muchas veces con la Orquesta Filarmónica Eslovaca. En el estreno de la Misa Glagólica de Janáček en Taiwán en 2000, tocó el órgano solista con la Orquesta Sinfónica Nacional de Taiwán y ha dado recitales de órgano en muchos estados europeos, Japón, en Estados Unidos, México, Canadá, Rusia, Uzbekistán y Kazajistán. Stanislav Šurin ha grabado varios CD de órgano solo (Catedral de Graz, Schubertkirche de Viena, Catedral de San Juan Bautista de Trnava, etc.). En 2000 organizó una conferencia musicológica internacional centrada en la protección de los órganos históricos. De 1999 a 2002 fue redactor jefe de AdoramusTe (revista de música sacra), fundador y organizador de festivales de órgano en Trnava, Piešťany, Skalica y en la catedral de San Martín de Bratislava. En los años 2006-2008 actuó como músico diocesano de la archidiócesis de Bratislava-Trnava. Desde 2002 es profesor de órgano en la Universidad Católica de Ružomberok. Actúa como asesor para la restauración de órganos históricos y para la construcción de nuevos instrumentos (Filarmónica Eslovaca, Catedral de San Martín de Bratislava, etc.). También se ha dedicado a la composición. Es autor de la Misa de Trnava (en 2016 publicó un CD con la Orquesta Filarmónica Eslovaca) y de varias composiciones basadas en textos eclesiásticos y litúrgicos. Compuso música para varios poemas de poetas eslovacos y franceses. En 2011 la Sociedad de San Adalberto publicó su libro de canciones y CD titulado Antífonas y canciones espirituales. A principios de 2013, la Celebrity Service Agency publicó su álbum de canciones basado en poemas de Miroslav Valek y publicado con el nombre Lady on the Train. Por su extraordinaria contribución al mensaje de la obra de Johann Sebastian Bach para los contemporáneos, en 2009 recibió el premio «Sebastian» de la asociación Ars Ante Portas. En 2016 recibió el premio «Fra Angelico» de la Conferencia Episcopal de Eslovaquia por la contribución de los valores cristianos al arte en Eslovaquia.